Diagnostiske og molekylære studier av norske Acinetobacter spp. isolater

Prosjektansvarlige og kontaktpersoner: Ørjan Samuelsen og Arnfinn Sundsfjord.

Prosjekt medarbeidere: Nabil Karah (PhD student), Bjørg Haldorsen (Spesialbioingeniør), Bettina Aasnæs (Overingeniør), Kristin Hegstad og Gunnar Skov Simonsen

Samarbeidspartnere: Norske mikrobiologiske laboratorium. 
 
Acinetobacter spp. er en gruppe Gram-negative bakterier vanligvis funnet i jord og vann med en kompleks taksonomi. Det er nå identifisert 33 forskjellige ”genome species” Acinetobacter spp. Klinisk har A. baumannii, Acinetobacter gen. sp. 3 og Acinetobacter gen. sp. 13TU blitt betraktet som de viktigste, men andre Acinetobacter species som A. johnsonii, A. junii, A. lwoffii, A. parvus, A. radioresistens, A. schindleri og A. ursingii har også blitt assosiert med kliniske infeksjoner. Korrekt fenotypisk identifisering av kliniske Acinetobacter ned på species nivå har vist seg å være problematisk. Epidemiologien og patologien til mange Acinetobacter species er derfor lite studert. 
Våre hovedmål er å:
i) Evaluere og etablere molekylære metoder for korrekt species identifisering av Acinetobacter og sammenligne med fenotypiske metoder.
ii) Karakterisere norske Acinetobacter spp. isolater fra blod kultur med hensyn på species distribusjon, resistensprofil og kliniske faktorer.
 
Utvalgte publikasjoner:
1. Karah N, Haldorsen B, Hegstad K, Sundsfjord A, Samuelsen Ø. on behalf of the Norwegian Study Group on Acinetobacter. 2009. Molecular identification and characterisation of Acinetobacter baumannii in Norwegian strain collections reveal major discrepancies to phenotypic identification and the presence of carbapenemase producing clonal lineages. 19th ECCMID, Helsinki, Finland