Prosjekter

Diagnostiske og molekylære studier av norske Acinetobacter spp. isolater

2010-05-25T09:43:00+02:00

Prosjektansvarlige og kontaktpersoner: Ørjan Samuelsen og Arnfinn Sundsfjord.

Prosjekt medarbeidere: Nabil Karah (PhD student), Bjørg Haldorsen (Spesialbioingeniør), Bettina Aasnæs (Overingeniør), Kristin Hegstad og Gunnar Skov Simonsen

Samarbeidspartnere: Norske mikrobiologiske laboratorium.

Acinetobacter spp. er en gruppe Gram-negative bakterier vanligvis funnet i jord og vann med en kompleks taksonomi. Det er nå identifisert 33 forskjellige ”genome species” Acinetobacter spp. Klinisk har A. baumannii, Acinetobacter gen. sp. 3 og Acinetobacter gen. sp. 13TU blitt betraktet som de viktigste, men andre Acinetobacter species som A. johnsonii, A. junii, A. lwoffii, A. parvus, A. radioresistens, A. schindleri og A. ursingii har også blitt assosiert med kliniske infeksjoner. Korrekt fenotypisk identifisering av kliniske Acinetobacter ned på species nivå har vist seg å være problematisk. Epidemiologien og patologien til mange Acinetobacter species er derfor lite studert.
Våre hovedmål er å:
i) Evaluere og etablere molekylære metoder for korrekt species identifisering av Acinetobacter og sammenligne med fenotypiske metoder.
ii) Karakterisere norske Acinetobacter spp. isolater fra blod kultur med hensyn på species distribusjon, resistensprofil og kliniske faktorer.

Utvalgte publikasjoner:
1. Karah N, Haldorsen B, Hegstad K, Sundsfjord A, Samuelsen Ø. on behalf of the Norwegian Study Group on Acinetobacter. 2009. Molecular identification and characterisation of Acinetobacter baumannii in Norwegian strain collections reveal major discrepancies to phenotypic identification and the presence of carbapenemase producing clonal lineages. 19th ECCMID, Helsinki, Finland

Plasmid-mediert kinolonresistens hos Enterobacteriaceae

2010-05-25T09:56:52+02:00

Prosjektansvarlige og kontaktpersoner: Ørjan Samuelsen og Arnfinn Sundsfjord

Prosjekt medarbeidere: Nabil Karah (Ph.D. student), Bjørg Haldorsen (Spesialbioingeniør), Bettina Aasnæs (Overingeniør),

Samarbeidpartnere: Gunnar Kahlmeter, Centrallasarettet Växjö, Sverige. Laurent Poirel, Hopital Le Bicetre, Paris, Frankrike.

Resistens mot fluorokinoloner har tradisjonelt blitt forårsaket av kromosomale mutasjoner og dermed bare spredt seg vertikalt i bakteriepopulasjoner. Nylig har det blitt oppdaget 3 nye kinolonresistens determinanter som er lokalisert på overførbare plasmider og dermed muliggjør økt spredning av kinolonresistens. Denne resistensen er mediert av penta-peptid proteiner (Qnr), et mutert aminoglykosid acteyl-transferase protein (AAC(6’)-Ib-cr) eller en effluks pumpe (QepA). Disse determinantene forårsaker lav-gradig kinolon resistens, men øker muligheten til bakteriene å utvikle kromosomale mutasjoner som fører til høy-gradig resistens.

Våre hovedmål er å:
(i) Undersøke prevalensen av plasmidmediert kinolonresistens i relevante stammesamlinger fra Norge og Sverige samt
(ii) Karakterisering av genetiske elementer/plasmider involvert i horisontal overføring.

Utvalgte publikasjoner:
1. Karah N, Poirel L, Bengtsson S, Sundqvist M, Kahlmeter G, Nordmann P, Sundsfjord A, Samuelsen Ø, and the Norwegian Study Group on PMQR. 2010. Plasmid-mediated quinolone resistance determinants qnr and aac(6’)-Ib-cr in Escherichia coli and Klebsiella spp. from Norway and Sweden. Diagn. Microbiol. Infect. Dis. 66:425-431.
2. Karah N, Poirel L, Sundquist M, Kahlmeter G, Bengtsson S, Nordmann P, Sundsfjord A. Samuelsen Ø. 2008. Low prevalence of plasmid-mediated quinolone resistance in Norwegian and Swedish clinical isolates of Escherichia coli and Klebsiella spp. Abstrakt 18th European Congress of Clinical Microbiology and Infectious Diseases (ECCMID), Barcelona, Spain.
3. Samuelsen Ø, Vorobieva V, Naseer U, Poirel L, Walsh T, Nordmann P, Bazhukova T, Semenova N, Haldorsen B, Aasnæs B, Karah N, Sundsfjord A. 2007. Identification of aac(6')-lb-cr in clinical isolates of Escherichia coli and Klebsiella pneumoniae from Russia. Abstrakt General Meeting American Society for Microbiology, Toronto, Canada.pdf
4. S. Bengtsson, M. Sundquist, Ø. Samuelsen, N. Karah, A. Sundsfjord, and G. Kahlmeter. 2007. Fluoroquinolone resistance in nalidixic acid resistant Escherichia coli. Abstrakt 17th European Congress of Clinical Microbiology and Infectious Diseases (ECCMID), Munich, Germany

Nedregulering av gen uttrykk i Gram-positive bakterier vha ”anti-RNA” strategier

2010-05-25T10:03:07+02:00

Prosjektansvarlige og kontaktpersoner: Kristin Hegstad og Eirik Wasmuth Lundblad

Samarbeidspartner: Sidney Altman, Professor, Yale University, USA.

RNA baserte teknikker har et stort potensial som verktøy i mikrobiell funksjonell genomforskning og som et nytt terapeutikum i bekjempelse av infeksjoner. Antisense teknologier har vist seg å være effektive mht nedregulering av genuttrykk gjennom sekvensspesifikk gjenkjenning og degradering av mRNA. Vi ønsker å etablere en metode for nedregulering av genuttrykk i enterokokker for å identifisere faktorer involvert i utvikling, spredning og persistens av antibiotikaresistente patogene enterokokker. Vi arbeider med to ulike metoder for nedregulering av genuttrykk; (i) vha modifiserte oligonukleotider og (ii) vha RNase P. RNase P er et essensielt enzym som gjenkjenner og kløyver RNA strukturer som ligner dens naturlige substrater. RNase P-mediert mRNA kløyving induseres av antisense oligoer (guide sekvenser) som designes for å binde sekvensspesifikt til mRNA fra selekterte mål gener. Denne bindingen gir strukturer som ligner naturlige RNase P substrater i cella.

Hovedmål:
i) Utvikle «anti-RNA» verktøy for nedregulering av uttrykk av spesifikke gener i enterokokker.
ii) Benytte disse «anti-RNA» verktøyene til funksjonelle studier av gener involvert i antimikrobiell resistens, spredning, persistens og virulens.
iii) Teste «anti-RNA» verktøy in vivo hvis in vitro eksperimentene er vellykkede.

Publikasjoner:
1. Lundblad EW and Altman S. 2010. Inhibition of gene expression by RNase P. Review. New Biotech. Accepted.
2. Lundblad EW, Xiao G, KO JH, and Altman S. 2008. Rapid selection of accessible and cleavable sites in RNA by Escherichia coli RNase P and random external guide sequences. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 105:2354-7.
3. Xiao G., Lundblad EW., Izadjoo M., and Altman S. 2008. Inhibition of expression in Escherichia coli of a virulence regulator MglB of Francisella tularensis using external guide sequence technology. PLoS ONE 3:e3719.
4. Lundblad EW. 2008. Shoot the messenger strategies in Bacteria. Presentation. Annual meeting Norwegian Society for Microbiology, Tromsø, Norge.
5. Dahl KH. 2006. Down-regulation of gene expression in Gram-positive bacteria using ribonuclease P (RNase P). Presentation. RNA minisymposium, The molecular biology of RNA group.

Fenotypiske, genotypiske og molekylære epidemiologiske studier av ESBL-og AmpC-produserende kliniske Escherichia coli og Klebsiella spp. isolater i Norge.

2010-05-21T12:23:58+02:00

Prosjektansvarlige og kontaktpersoner: Eirik W. Lundblad og Arnfinn Sundsfjord.

Prosjekt medarbeidere: Lise Igeltjørn, Umaer Naseer, Bettina Aasnæs, Bjørg Haldorsen og Gunnar Skov Simonsen.

Infeksjoner med multiresistente Gram-negative bakterier representerer et økende og alvorlig problem globalt og nasjonalt. Dette gjelder først og fremst spredningen av særlig bredspektrede betalaktamaser, herunder ESBLA (klassiske ESBL) og ESBLM (oftest plasmidmediert AmpC), som ofte er koblet til andre resistensegenskaper. Etableringen av slike resistensmekanismer er mest utbredt i familien Enterobacteriaceae og sees oftest i kliniske diagnostiske laboratorier som multiresistente isolater av Escherichia coli og Klebsiella pneumoniae. Vi har i slike tilfeller svært få effektive behandlingsalternativer særlig når det gjelder perorale antibiotika. Vi studerer tilsendte kliniske isolater fra norske diagnostiske laboratorier med hensyn til resistensfenotypi/-genotypi, molekylær epidemiologi og evaluerer kontinuerlig metoder for påvisning. Videre vil vi i samarbeid med andre forskningsmiljøer starte opp en evaluering av in vivo effektivitet av eldre antibiotika særlig i behandlingen av urinveisinfeksjoner for å se om dette kan gi et vitenskapelig grunnlag for flere behandlingsalternativer.

Våre hovedmål er å:
i) Evaluere fenotypiske og molekylære metoder for å påvise og bekrefte ESBLA/M-produksjon i norske kliniske Enterobacteriaceae-isolater.
ii) Molekylær typing av norske kliniske ESBLA/M-produserende E. coli og Klebsiella spp-isolater.
iii) Undersøke in vivo effektivitet av ulike antibiotika i behandling av infeksjoner med multiresistente Gram-negative bakterier i dyremodeller.

Utvalgte publikasjoner:
1. Naseer U, Haldorsen B, Simonsen GS, Sundsfjord A. 2009. Sporadic occurrence of CMY-2 producing multidrug resistant Escherichia coli of ST-complexes 38, 448 and ST131 in Norway. Clin Microbiol Infect. 2009 Jun 22. [Epub ahead of print]
2. Naseer U, Haldorsen B, Tofteland S, Hegstad K, Scheutz F, Simonsen GS, Sundsfjord A. 2009. Molecular characterisation of CTX-M producing clinical isolates of Escherichia coli reveals the spread of multi-drug resistant CTX-M-15 ST-131 (O25:H4) and ST-964 (O102:H6) strains in Norway.APMIS. 2009 Jul;117(7):526-36.
3. Naseer U, Haldorsen B, Simonsen GS, Sundsfjord A. 2009. Sporadic occurence of CMY-2 producing multidrug-resistant Escherichia coli of clonal complex [CC]48, CC38 and CC131 in Norway, 2003-2007. Indications for globally disseminated clones? Abstract 19th European Congress of Clinical Microbiology and Infectious Diseases (ECCMID), Helsinki, Finland.
4. Haldorsen B, Aasnæs B, Dahl KH, Hanssen AM, Simonsen GS, Walsh T, Sundsfjord A, Lundblad EW. 2008. The AmpC phenotype in Norwegian isolates of Escherichia coli is associated with an acquired ISEcp1-like ampC element or hyperproductin of the endogenous AmpC. J Antimicrob Chemother. 2008 Oct;62(4):694-702.
5. Aasnæs B, Haldorsen B, Dahl KH, Simonsen GS, Sundsfjord A, Lundblad EW. 2008. Expression analyses of the native ampC gene in Norwegian clinical isolates of Escherichia coli with defined ampC promoter mutations and an AmpC resistance prophile. Abstract 18th European Congress of Clinical Microbiology and Infectious Diseases (ECCMID), Barcelona, Spain 2008. pdf
6. Naseer U, Haldorsen B, Dahl KH, Scheutz F, Simonsen GS, Walsh TR, Sundsfjord A and the Norwegian ESBL study group. 2007. CTX-M producing multi-drug resistant clinical isolates of Eschericia coli in Norway are associated with virulent genetic lineages. Abstract ASM 2007.pdf
7. Giske C, Haldorsen B, Lundblad E, Aasnæs B, Bylund L, Ho P, Simonsen G, Yusof A, Sundsfjord A. 2007. Phenotypic detection of AmpC: comparison of Etest AmpC strips and disk synergy assays with cloxacillin, boronic acid and EDTA. Abstract 17th European Congress of Clinical Microbiology and Infectious Diseases (ECCMID), Munich, Germany 2007.pdf
8. Haldorsen B, Aasnæs B, Dahl KH, Hanssen AM, Simonsen G, Walsh TR, Toleman MA, Sundsfjord A, Lundblad E. 2007. Genetic characterisation of Norwegian Escherichia coli isolates with an AmpC-resistance profile Abstract 17th European Congress of Clinical Microbiology and Infectious Diseases (ECCMID), Munich, Germany 2007.
9. Naseer U, Natås O, Haldorsen BC, Bue B, Grundt H, Walsh TR, Sundsfjord A. 2007. Nosocomial outbreak of CTX-M-15-producing E. coli in Norway. APMIS 114: 120-126
10. Tofteland S, Haldorsen B, Dahl KH, Simonsen GS, Steinbakk M, Walsh TR, Sundsfjord A, and the Norwegian ESBL study group. 2007. Effects of phenotype and genotype on methods for detection of extended-spectrum-β-lactamase-producing clinical isolates of Escherichia coli and Klebsiella pneumoniae in Norway. J Clin Microbiol 45:199-205.pdf
11. Naseer U, Haldorsen BC, Tofteland S, Dahl KH, Simonsen GS, Walsh TR, Sundsfjord A. 2006. Virulent clones of E. coli are associated with CTX-M type ESBL-production and multi-resistance in Norway. Årskonferansen, Nasjonalt Folkehelseinstitutt, Oslo, Norway.
12. Haldorsen B, Lundblad EW, Aasnæs B, Dahl KH, Hanssen A-M, Simonsen GS, Walsh T, Sundsfjord A. 2006. Evaluation of an AmpC disk test and genetic detection of imported ampC-genes in Norwegian clinical strains of E. coli. Abstract 16th European Congress of Clinical Microbiology and Infectious Diseases (ECCMID), Nice, France 2006.pdf
13. Haldorsen B, Natås OB, Grundt H, Bue B, Naseer U, Walsh T, Sundsfjord A. A nosocomial outbreak of CTX-M-15 producing E. coli in Norway. Abstract 15th ECCMID, Copenhagen, Denmark 2005.pdf

Spredning og persistens av vankomycin og høygradig gentamicin resistensdeterminanter i Enterococcus faecium

2010-05-21T11:57:28+02:00

Prosjektansvarlige og kontaktpersoner: Kristin Hegstad and Torunn Pedersen

Prosjektmedarbeidere: Theresa Mikalsen (post.doc), Eva K. Bjørkeng (PhD student), Belinda Langnes (PhD student), Torill C. Rosvoll (PhD student), Bettina Aasnæs, Tonje Ø. Holan (master student), Eirik W. Lundblad, Arnfinn Sundsfjord.

Samarbeidspartnere: Karin Tegmark-Wisell, MD/PhD and Barbro Liljequist, PhD, SMI, Sweden; Rob JL. Willems, PhD, University Medical Center Utrecht, the Netherlands; Anette M. Hammerum, PhD, Statens Serum Institut, Denmark, Arne Smalås, Professor, NorStruct, UiT.

The number of hospital acquired infections caused by Enterococcus faecium has increased significantly and is well documented in Scandinavian countries. The invasive E. faecium strains are associated with ampicillin resistance and high-level gentamicin resistance, and in Sweden also combined with transferable vancomycin resistance (VRE). The annual number of VRE cases in Sweden has increased from 18 to 618 between 2000 and 2008, with a clonal predominance of vanB E. faecium (www.smittskyddsinstitutet.se). We are currently identifying the genetic elements of the E. faecium clone involved in this outbreak. A hospital adapted genetic lineage, clonal complex 17 (CC17) has been associated with the majority of hospital-related E. faecium infections globally. Our limited knowledge regarding the Scandinavian CC17-epidemiology warrants further molecular studies. Analyses of a vanB type VRE outbreak in Ørebro, Sweden during 2003-2004 (1) showed a polyclonal occurrence of CC17-related strains containing mostly plasmid mediated vanB as part of conjugative transposon Tn5382 (13) linked to a plasmid (pRUM) maintenance/toxin-antitoxin (TA) system (Axe-Txe). A plasmid maintenance system (ω-ε-ζ) has also been involved in the long-term persistence of VRE in non-selective environments in Norway (2-5, 7-9, 12,14). Mechanisms controlling plasmid maintenance, including the TA systems are considered to be potential targets for novel antibacterial drug intervention [DeNap 2005, Engelberg- Kulka 2004]. By targeting a drug toward the antitoxin, the toxin itself would attack the cell from the inside.

Hovedmål:
i) Være referanse laboratorium for påvisning og bekreftelse vankomycin resistensdeterminanter i enterokokker og utføre molekylærepidemiologiske studier av VRE kloner.
ii) Evaluere og videreutvikle fenotypiske og genotypiske metoder for å påvisning av VRE.
iii) Detaljert molekylær karakterisering av mobile genetiske elementer, bakterielinjer, og virulens gener hos selekterte kloner.
iv) Identifisere kloner og plasmider involvert i spredning av HLGR mellom invasive E. faecium i en representativ samling av isolater fra Norge og Danmark.
v) Screene invasive stammer for tilstedeværelse av plasmidavhengighetssystemer og deres linking til replicon typer samt antimikrobiell resistens og mobilitetsdeterminanter.
vi) Karakterisere avhengighetssystemer og mobilitetsdeterminanter i selekterte kliniske resistensplasmider.
vii) In vivo karakterisering av uttrykk og biologisk aktivitet hos TA systemer (Axe-Txe og ω-ε-ζ).
viii) Identifisere potensielle inhibitorer for toksin-antitoksin interaksjonen ved hjelp av virtual ligand screening med eksisterende krystallstrukturer som templater og utvikle assays for å monitorere protein-protein interaksjonen mellom toksin og antitoksin in vivo og/eller in vitro.

Utvalgte publikasjoner:
1. Bjørkeng E, Rasmussen G, Sundsfjord A, Sjöberg L, Hegstad K, Söderquist B. In manuscript. Clustering of polyclonal VanB-type vancomycin resistant Enterococcus faecium in a low-endemic area was associated with CC17-genogroup strains harboring transferable vanB2-Tn5382 containing pRUM-like plasmids with axe-txe plasmid addiction systems.
2. Rosvoll TC, Pedersen T, Sletvold H, Johnsen PJ, Sollid JE, Simonsen GS, Jensen LB, Nielsen KM, Sundsfjord A. 2009 Nov 17. [Epub ahead of print]. PCR-based plasmid typing in Enterococcus faecium strains reveals widely distributed pRE25-, pRUM-, pIP501-, and pHTβ-related replicons associated with glycopeptides resistance and stabilizing toxin-antitoxin systems. FEMS Immunol Med Microbiol.
3. Johnsen PJ, Townsend JP, Bøhn T, Simonsen GS, Sundsfjord A, Nielsen KM. 2009. Factors affecting the reversal of antimicrobial-drug resistance. Lancet Infect Dis 9:357-364.
4. Pedersen T, Rosvoll TCS, Langnes B, Sundsfjord A. 2009. Distribution, localization and expression of the Axe-Txe toxin-antitoxin (TA) loci in a collection of Enterococcus faecium strains. Presentation. ESCMID Conference. Enterococci - from Animals to Man. Barcelona, Spain.
5. Langnes B, Rosvoll TCS, Sollid JE, Sundsfjord A and Pedersen T. 2009. Distribution and expression of the ω-ε-ζ and Axe-Txe toxin-antitoxin (TA) genes in a collection of Enterococcus faecium strains. Presentation. 3rd FEMS Congress of European Microbiologists, Gothenburg, Sweden.
6. Sun J, Song X, Kristiansen BE, Kjaereng A, Willems RJ, Eriksen HM, Sundsfjord A, Sollid JE. 2009. Occurrence, population structure, and antimicrobial resistance of enterococci in marginal and apical periodontitis. J Clin Microbiol 47:2218-2225.
7. Sletvold H, Johnsen PJ, Hamre I, Simonsen GS, Sundsfjord A, and Nielsen KM. 2008. Complete sequence of Enterococcus faecium pVEF3 and the detection of an omega-epsilon-zeta toxin-antitoxin module and an ABC transporter. Plasmid 60:75-85.
8. Dahl KH, Mater DDG, Flores MJ, Johnsen PJ, Midtvedt T, Corthier G, Sundsfjord A. 2007. Transfer of plasmid and chromosomal glycopeptide resistance determinants occurs more readily in the digestive tract of mice than in vitro and exconjugants can persist stably in vivo in the absence of glycopeptide selection. J Antimicrob Chemother 59:478-486.
9. Sletvold H, Johnsen PJ, Simonsen GS, Aasnæs B, Sundsfjord A, Nielsen KM. 2007. Comparative DNA analysis of two vanA plasmids from Enterococcus faecium strains isolated from poultry and a poultry farmer in Norway. Antimicrob Agents Chemother 51:736-739.
10. Bjørkeng EK, Tadesse G, Butaye P, Willems R, Sollid JE, Sundsfjord A, Dahl KH. 2006. Dissemination of ccrA- and ccrB-like in CC-17 of Enterococcus faecium. Presentation. National Conference on Microbial Sciences and Technology, Oslo, Norway.
11. Dahl KH, Bjørkeng EK, Tadesse G, Butaye P, Willems R, Sollid JE, Sundsfjord A. 2006. Dissemination of ccrA- and ccrB-like in enterococci. Abstract. 2nd FEMS Congress of European Microbiologists, Madrid, Spain.
12. Sørum M, Johnsen PJ, Aasnes B, Rosvoll T, Kruse H, Sundsfjord A, Simonsen GS. 2006. Prevalence, persistence, and molecular characterization of glycopeptides-resistant enterococci in Norwegian poultry and poultry farmers 3 to 8 years after the ban on avoparcin. Appl Environ Microbiol 72:516-521.
13. Werner G, Dahl KH, Willems RJL. 2006. Composite elements encoding antibiotic resistance in Enterococcus faecium and Enterococcus faecalis, p. 157-208. In N Kobayashi. (ed.), Drug Resistance of Enterococci: Epidemiology and Molecular Mechanisms. Research signpost, Kerala, India. ISBN: 81-7736-290-9.
14. Johnsen PJ, Østerhus JI, Sletvold H, Sørum M, Kruse H, Nielsen K, Simonsen GS, Sundsfjord A. 2005. Persistence of animal and human glycopeptide-resistant enterococci on two Norwegian poultry farms formerly exposed to avoparcin is associated with a widespread plasmid-mediated vanA element within a polyclonal Enterococcus faecium population. Appl Environ Microbiol. 71:159-68.

Diagnostiske og molekylære studier av ESBL-CARBA (karbapenemaser) hos Gram-negative bakterier

2010-05-21T10:59:13+02:00

Prosjektansvarlige og kontaktpersoner: Ørjan Samuelsen og Arnfinn Sundsfjord.

Prosjekt medarbeidere: Nabil Karah (PhD student), Pardha Saradhi (PhD student), Bjørg Haldorsen (spesialbioingeniør), Bettina Aasnæs (overingeniør), Kristin Hegstad og Gunnar Skov Simonsen.

Samarbeidspartnere: Christian G. Giske, Karolinska Institutet, Stockholm, Sverige, Timothy Walsh og Mark A. Toleman, Cardiff University, UK. James Spencer, University of Bristol, UK, Hanna-Kirsti Schrøder Leiros, NORSTRUCT, Universitetet i Tromsø, og MabCent, Universitetet i Tromsø, Norske mikrobiologiske laboratorium.

ESBL-CARBA er ß-laktamaser som hydrolyserer karbapenemer som er den nyeste gruppen av ß-laktamer. De viktigste ESBL-CARBA enzymene er metallo-ß-laktamaser (MBL), Klebsiella pneumoniae carbapenemase (KPC) og OXA-karbapenemaser som nå er blitt oppdaget i forskjellige deler av verden. I noen regioner som sør-Europa, Asia, Sør-Amerika og øst-kysten av USA er dette blitt et stort problem. Spredning av disse enzymene hos Gram-negative bakterier har ført til terapeutiske problemer siden de kan hydrolysere nesten alle ß-laktam antibiotika. I tillegg er disse enzymene resistente mot tilgjengelige terapeutiske inhibitorer. Genene som koder for ESBL-CARBA enzymene sitter ofte på mobile genetiske elementer (plasmider/transposoner) og elementer som ofte innehar andre resistensgener (f.eks. resistensgener som koder for aminoglykosid resistens). Dette øker muligheten for økt spredning og er med på å redusere behandlingsmulighetene ytterligere. I Norge er disse ESBL-CARBA enzymer oppdaget i multi-resistente P. aeruginosa, K. pneumoniae, E. coli, og Acinetobacter baumannii isolater. Noen av disse isolatene er resistente mot alle tilgjengelige antibiotika. De fleste av disse isolatene er assosiert med import fra utlandet, men det er også oppdaget isolater i Norge hvor import er lite sannsynlig.

Våre hovedmål er å:
i) Være referanse laboratorium for påvisning og bekreftelse av ESBL-CARBA produksjon i Gram-negative bakterier.
ii) Evaluere og videreutvikle fenotypiske og genotypiske metoder for å påvisning av ESBL-CARBA-produserende bakterier.
iii) Utføre molekylær karakterisering og epidemiologiske studier på ESBL-CARBA isolater.
iv) Biokjemisk karakterisering og struktur bestemmelse av forskjellige overførbare MBL varianter.
v) Identifisere mulige inhibitorer mot MBL enzymer ved hjelp av bioprospektering av marine organismer samt virtuell ligand screening.

Utvalgte publikasjoner:
1. Samuelsen Ø, Toleman MA, Sundsfjord A, Rydberg J, Leegaard TM, Walder M, Lia A, Ranheim TE, Rajendra Y, Hermansen NO, Walsh TR, Giske CG. 2010. Molecular epidemiology of metallo-beta-lactamase producing Pseudomonas aeruginosa from Norway and Sweden show import of international clones and local clonal expansion. Antimicrob. Agents Chemother. 54(1):346-352.
2. Gantha SR, Perumal S, Pagadala SR, Samuelsen Ø, Spencer J, Pratt RF, and Buynak JD. 2009. Approaches to the simultaneous inactivation of metallo- and serine-beta-lactamases. Bioorg Med Chem Lett. 19(6):1618-1622.
3. Samuelsen Ø, Naseer U, Tofteland S, Skutlaberg DH, Onken A, Hjetland R, Sundsfjord A, Giske CG. 2009. Emergence of clonally related Klebsiella pneumoniae isolates of sequence type 258 producing plasmid-mediated KPC carbapenemase in Norway and Sweden. J. Antimicrob. Chemother. 63(4):654-658.
4. Samuelsen Ø, Buarø L, Toleman MA, Giske CG, Hermansen NO, Walsh TR, and Sundsfjord A. 2009 The First Metallo-Beta-Lactamase Identified in Norway is Associated with an tniC-class 1 Integron in a Pseudomonas aeruginosa Isolate of Sequence Type 233 Imported from Ghana. Antimicrob. Agents Chemother. 53(1):331-332.
5. Samuelsen Ø, Castanheira M, Walsh TR, Spencer J. 2008. Kinetic Characterization of VIM-7, A - Divergent Member of the VIM Metallo-Beta-Lactamase Family. Antimicrob. Agents. Chemother. 52(8):2905-2908. pdf
6. Samuelsen Ø, Buarø L, Giske CG, Simonsen GS, Aasnæs B, Sundsfjord A. 2008. Evaluation of phenotypic tests for the detection of metallo-beta-lactamase-producing Pseudomonas aeruginosa in a low prevalence country. JAC:61 (827-830). pdf
7. Walsh TR, Onken A, Haldorsen B, Toleman MA, Sundsfjord A. 2005. Characterization of a carbapenemase-producing clinical isolate of Bacteroides fragilis in Scandinavian: genetic analysis of a unique insertion sequence. Scand J Infect Dis 37:676-679.